Postdoc-Stelle in räumlicher Genomik aquatischer Wirbelloser (3 Jahre)

• 03. Juli 2026 • 100% • Festanstellung • Dübendorf Eawag, das Schweizerische Bundesinstitut für Aquatische Wissenschaft und Technologie, ist ein international vernetztes aquatisches Forschungsinstitut innerhalb des ETH-Bereichs (Schweizerische Eidgenössische Technische Hochschulen). Eawag betreibt Forschung, Ausbildung und Expertenberatung, um die beiden Ziele zu erreichen, die direkten menschlichen Bedürfnisse an Wasser zu decken und die Funktion und Integrität aquatischer Ökosysteme zu erhalten. Postdoc-Stelle in räumlicher Genomik aquatischer Wirbelloser (3 Jahre)# Die Altermatt-Forschungsgruppe am Department für Aquatische Ökologie bei Eawag und dem Department für Evolutionäre Biologie und Umweltwissenschaften (IEU) an der Universität Zürich hat eine Stelle für eine Genetische Vielfalt ist die Grundlage für natürliche Selektion und Anpassung an Umweltveränderungen und erfasst gegenwärtige und vergangene Populationsdynamiken. Ihr Verständnis ist daher sowohl aus akademischer als auch aus managementbezogener Sicht zentral. Allerdings ist das gegenwärtige Verständnis genetischer Vielfalt noch weitgehend verstreut und basiert größtenteils auf einer kleinen Anzahl genetischer Marker. Aktuelle Fortschritte in der Analyse von Whole-Genome-Sequenzierungsdaten bieten ungeahnte Möglichkeiten, intraspezifische genetische Vielfalt, Populationsstruktur und adaptive Vielfalt in viel größerem Detail zu charakterisieren. Sie ermöglichen auch die Rekonstruktion der jüngsten demografischen Geschichte, einschließlich Muster von Inzucht und Änderungen der effektiven Populationsgröße (Ne), wodurch die Identifizierung von Populationen ermöglicht wird, die besonders anfällig sind. OneBioNet-G: Genetische Vielfalt von Schlüsselarten aquatischer Wirbelloser in kleinen Wasserflächen in der Schweiz ist ein Querschnittsprojekt, das von der 2. Schweizerischen Biodiversitätsaktionsplan (AP SBS II) des Schweizerischen Bundesamtes für Umwelt (FOEN/BAFU) finanziert wird. Unser Ziel ist es, genetische/genomische Vielfalt über mehrere aquatische Wirbelloser in der Schweiz zu integrieren, um ihre genetische Zusammensetzung und Vernetzung zu verstehen und sie mit zukünftigen Klima- und Landnutzungsänderungen im großen Maßstab in Verbindung zu bringen. In diesem PostDoc-Projekt werden Sie die genomische Vielfalt mehrerer aquatischer Schlüsselarten in einem räumlich expliziten Ansatz etablieren und analysieren. Dazu gehören insbesondere a) die De-Novo-Sequenzierung und -Assembly von Draft-Genomen für mehrere aquatische Insekten- (Eintags-, Stein- und Köcherfliegen, EPT) und Amphipodenarten, b) die Etablierung von genomischen Daten für ~2.000 Individuen über Dutzende von Populationen (unter Verwendung von Whole-Genome-Sequenzierung / ddRAD-Ansätzen), c) die Inferenz genetischer Vielfalt, Vernetzung und adaptiver genetischer Variation, einschließlich retrospektiver Änderungen in Inzucht und effektiven Populationsgrößen, d) die Durchführung räumlich expliziter Analysen der genetischen/genomischen Vielfalt und ihre Verbindung zu Flussnetztopologie, Umweltvariablen und biogeografischen Treibern und e) die Bewertung der Machbarkeit, Stärken und potenziellen Einschränkungen von Population-Genomik-Überwachungsansätzen für ein nationales genetisches Vielfalts-Monitoring-Programm. Das Projekt ist vollständig von FOEN/BAFU finanziert, verknüpft mit der OneBioNet-Initiative - Förderung der funktionalen Vernetzung ökologisch wertvoller Gebiete durch ein sozio-ökologisches System - und baut auf einer Schweizer Pilotstudie für die Überwachung genetischer Vielfalt auf (siehe auch hier). Das Projekt hat einen starken Fokus auf die Etablierung von Basisgenomdaten für Schweizer aquatische Wirbelloser und wird in enger Zusammenarbeit mit Stakeholdern durchgeführt. Die Stelle soll mit einem motivierten Kandidaten besetzt werden, der in der Lage ist, eine führende Rolle in fortgeschrittenen genetischen Analysen zu übernehmen und über starke Expertise in Genomik verfügt, einschließlich Labor-, bioinformatischer und räumlicher Analysen. Dieses Projekt baut auf Organismen auf, die innerhalb repräsentativer Stichprobenkampagnen (Schweizer Biodiversitäts-Monitoring und Amphipod.ch) gesammelt wurden. Sie werden Draft-Genome für eine ausgewählte Anzahl von 3-5 EPT- und 2-3 Amphipodenarten etablieren, Populations-WGS- und/oder ddRAD-Sequenzierungsdaten pro Art etablieren (das Projekt führend, jedoch mit umfassender Labor-Techniker-Unterstützung) und genome-weite genetische Vielfalt, adaptive genetische Vielfalt, genetische Vernetzung und räumliche Netzwerkstruktur, Inzucht und effektive Populationsgrößen analysieren. Sie werden die Analyse, Implementierung dieser Indizes und die Entwicklung möglicher Überwachungsstrategien für genetisches Monitoring zusammen mit Stakeholdern leiten. Um sich zu bewerben, müssen Sie einen PhD-Abschluss in Molekularer Ökologie, Ökologie, Biodiversitäts-Wissenschaften oder einem eng verwandten Wissenschaftsfeld haben. Sie müssen nachgewiesene Labor- und Bioinformatik-Erfahrung in Whole-Genome-Sequenzierung und/oder ddRAD-Sequenzierung haben und Kenntnisse in der Analyse von Genomdaten. Erfahrung in Bioinformatik, räumlicher Verteilungsmodellierung oder Programmierung ist ein Plus. Eine starke konzeptionelle Grundlage in molekularer Ökologie und ein gutes Verständnis ökologischer Theorie und Datenanalyse werden erwartet. Nachgewiesene Fähigkeiten in wissenschaftlichem Schreiben sind erforderlich. Die Arbeitsprache in den Gruppen ist Englisch. Fluency in Englisch ist erforderlich. Zusätzliche Deutsch- oder Französisch-Kenntnisse sind wünschenswert für Stakeholder-Interaktionen. Das Gesamtprojekt wird von Prof. Dr. Florian Altermatt bei Eawag/UZH geleitet. Der erfolgreiche Bewerber wird bei Eawag (Dübendorf, Schweiz) ansässig und eingestellt. Das Projekt umfasst Zusammenarbeit mit Stakeholdern bei FOEN/BAFU, WSL, Universität Lausanne und dem Genetic Diversity Centre (GDC) bei ETH Zürich. Das Projekt bietet eine h