Responsable de laboratoire

Le Quake Laboratory sera établi à l'ETH Zürich en 2026 par Stephen Quake, qui quitte la Stanford University. Le laboratoire travaille à l'interface de la physique, de l'ingénierie et de la biologie, développant de nouvelles approches de mesure et de modélisation qui transforment ce qu'il est possible d'apprendre des cellules individuelles et de quantités minimes de matériel moléculaire. Trois programmes de recherche majeurs fonctionneront en parallèle : (1) la reconstruction de l'architecture régulatrice d'E. coli à haute résolution comme fondement de modèles prédictifs de la régulation génique ; (2) la création d'atlas de cellules uniques à grande échelle de tissus humains et d'organismes modèles — incluant un premier atlas du système nerveux autonome humain — et l'entraînement de modèles d'IA/fondation sur ces atlas pour interroger la biologie du vieillissement et l'évolution de la multicellularité ; et (3) l'avancement des approches de biopsie liquide qui lisent les acides nucléiques libres de cellules à partir du sang pour détecter des maladies et surveiller la physiologie en collaboration avec des partenaires externes. Le laboratoire sera un environnement multidisciplinaire d'environ 10 personnes comprenant des biologistes moléculaires, des biochimistes, des biologistes computationnels, des chercheurs en apprentissage automatique, des physiciens et des ingénieurs, avec des collaborations actives à travers l'ETH, l'EPFL, l'University of Zürich et à l'international. Le Responsable de laboratoire est la colonne vertébrale opérationnelle du groupe. Vous serez responsable du fonctionnement quotidien d'un laboratoire humide complexe et multimodal — de la biologie moléculaire bactérienne au traitement d'échantillons cliniques humains, en passant par le séquençage à haut débit — tout en servant de chercheur senior de paillasse, de formateur et de conseiller de confiance du PI sur tout ce qui permet à un groupe de recherche productif de fonctionner. Ce rôle est idéal pour un chercheur expérimenté qui aime travailler sur plusieurs systèmes biologiques, construire des infrastructures, encadrer des collègues moins expérimentés et s'enorgueillir de l'excellence opérationnelle. On ne s'attendra pas à ce que vous dirigiez un programme de recherche indépendant distinct ; au contraire, vous permettrez et accélérerez celui de tous les autres. En retour, vous serez un contributeur clé et nommé sur une science ambitieuse, avec une véritable voix dans la manière dont le laboratoire est construit. Opérations de laboratoire et infrastructure Diriger le déploiement et l'exploitation continue des installations de paillasse du laboratoire à l'ETH, y compris la sélection de l'équipement, l'installation, la qualification et les contrats de maintenance de routine Établir et maintenir des ressources partagées : salles de culture cellulaire, zones BSL-2, zones de préparation au séquençage, stockage à -80 °C et à l'azote liquide, autoclaves, stocks de réactifs communs et calendriers d'instruments Assumer la responsabilité des commandes, des relations avec les fournisseurs, de la gestion des stocks et de l'organisation de l'économat pour les consommables et les réactifs ; négocier des accords-cadres lorsque cela est utile Maintenir et auditer les SOP de base, les systèmes de suivi des échantillons et les pratiques de cahier de laboratoire électronique au sein du groupe Servir d'interface du laboratoire avec les installations centrales de l'ETH (par exemple, Functional Genomics Center Zurich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) et les prestataires de services externes Biologie moléculaire bactérienne et biochimie — régulome d'E. coli Gérer et superviser un pipeline de clonage moléculaire pour E. coli — conception et assemblage de plasmides et de constructions intégrées au génome, construction de souches et stockage Mettre en place et maintenir des flux de travail biochimiques pertinents pour les études de régulation : expression et purification des protéines, transcription in vitro et biochimie quantitative selon les besoins des projets Établir une infrastructure de croissance microbienne, d'induction et de suivi temporel, incluant des lecteurs de plaques, des systèmes de culture continue et des interfaces de microfluidique si nécessaire Former les nouveaux membres du laboratoire à la microbiologie fondamentale, aux techniques stériles et à la génétique standard d'E. coli ; dépanner les projets de clonage et d'expression bloqués Biologie cellulaire mammalienne et manipulation de tissus — atlas de cellules uniques Gérer et superviser la culture de cellules mammaliennes (cellules primaires, cellules dérivées d'iPSC, lignées établies), y compris la préparation de milieux, l'authentification des lignées et la biobanque Établir des flux de travail robustes pour la dissociation des tissus, la préparation de suspensions de cellules uniques et de noyaux uniques, le tri cellulaire par FACS et l'évaluation de la qualité Coordonner le pipeline d'acquisition de tissus avec les partenaires cliniques et académiques — accords sur les spécimens biologiques, documentation de la chaîne de garde, logistique de fixation et d'expédition, manipulation d'échantillons approuvée par l'éthique Flux de travail de biopsie liquide et d'acides nucléiques libres de cellules Exploiter et maintenir des flux de travail d'extraction de cfDNA et cfRNA à faible apport Implémenter et affiner les protocoles de préparation de bibliothèques cfNA (WGS à faible apport, méthylation/EM-seq, fragmentomique, panels ciblés, cfRNA-seq) et contribuer au développement de méthodes pour de nouvelles modalités d'essai Établir des pratiques de gestion de la qualité appropriées aux échantillons de qualité clinique Séquençage à haut débit Servir de praticien senior du laboratoire pour les flux de travail de séquençage — y compris le QC des bibliothèques, le pooling, l'équilibrage et l'utilisation des instruments ou la coordination avec les fournisseurs