Postdoc in Computational Systems Biology and Metabolic Modeling

Berne, 100 % *La disregolazione del metabolismo lipidico gioca un ruolo chiave nello sviluppo e nella progressione dei disturbi metabolici, inclusi l'obesità, il diabete di tipo 2 e la malattia epatica steatosica associata a disfunzione metabolica (MASLD). Siamo alla ricerca di uno Scientist in Computational and Systems Biology altamente motivato per lavorare su un progetto finanziato dalla Swiss National Science Foundation (SNSF) volto ad avanzare la nostra comprensione del metabolismo lipidico umano nella MASLD. Il progetto si concentra sulla modellazione del metabolismo umano integrando dati clinici con modelli sperimentali. Coinvolge dati biochimici e molecolari da molteplici tessuti e biofluidi per investigare il metabolismo specifico dei tessuti, le interazioni metaboliche tra gli organi e l'assorbimento, la trasformazione e il rilascio di nutrienti. Il progetto combina la modellazione statistica, la biologia dei sistemi e la modellazione metabolica in silico con dati clinici, trascrittomici, proteomici, metabolomici/lipidomici, imaging molecolare spaziale e dati sperimentali del flusso metabolico per fornire nuove intuizioni sulle complesse alterazioni metaboliche alla base della MASLD.* Cosa puoi aspettarti ## • Sviluppare e applicare modelli matematici, statistici e di machine learning a dataset biologici e clinici complessi, ad alta dimensionalità e multimodali, inclusi dati spaziali e di imaging • Modellare il metabolismo dei lipidi e dei nutrienti utilizzando approcci compartimentali, cinetici, meccanicistici, di rete metabolica o basati sulla fisiologia • Ricostruire e modellare reti metaboliche specifiche dei tessuti e validare le previsioni del modello utilizzando dati sperimentali • Partecipare e contribuire a progetti di ricerca multidisciplinari e collaborativi. • Preparare, presentare e comunicare i risultati scientifici in riunioni interne, conferenze internazionali e attraverso pubblicazioni sottoposte a peer-review Il tuo profilo ## • PhD o equivalente in biologia computazionale, biologia dei sistemi, matematica applicata, ingegneria biochimica o un campo correlato • Forte competenza nella modellazione matematica e statistica, machine learning e biologia dei sistemi, con esperienza nell'analisi di dati biologici o clinici ad alta dimensionalità, multimodali o multi-omici • Esperienza dimostrata nella modellazione metabolica in silico, ad esempio modellazione metabolica basata su vincoli o su scala genomica, ricostruzione di reti metaboliche, modellazione cinetica o del flusso metabolico, o simulazione guidata dai dati • Padronanza di R, Python o MATLAB ed esperienza nell'integrare dati sperimentali con modelli computazionali; • L'esperienza in spettrometria di massa, spatial omics, imaging molecolare o imaging tissutale è un forte valore aggiunto • Scienziato entusiasta e collaborativo con forti capacità analitiche e di problem-solving, la capacità di lavorare indipendentemente e in team multidisciplinari, e un eccellente inglese scritto e parlato Cosa offriamo ## • Un ambiente di ricerca di supporto, collaborativo e all'avanguardia con opportunità di sviluppo scientifico e professionale • Partecipazione a progetti di ricerca multidisciplinari all'interfaccia tra biologia computazionale, biologia dei sistemi, metabolismo, multi-omica, imaging molecolare e ricerca clinica • L'opportunità di lavorare con grandi dataset provenienti da studi preclinici e clinici • Stretta collaborazione con esperti di diverse discipline scientifiche e cliniche ## Location Inselspital, Universitätsspital Organisation Centre for Laboratory Medicine, University Hospital Bern Workload 100 % Start 1 October 2026 or by agreement Reference 19495 Type of Contract Temporary Work Location Inselspital, Universitätsspital Bern Freiburgstrasse, CH-3010 Bern Schweiz