Scientifique NGS (single-cell et spatial Omics)

Pour notre Client, une entreprise pharmaceutique de premier plan basée à Basel, nous recherchons un Scientifique NGS motivé-

Les technologies single-cell et spatial omics transforment la recherche biomédicale en permettant une caractérisation approfondie de systèmes biologiques complexes à une résolution sans précédent. Ces technologies fournissent des informations critiques sur l'hétérogénéité cellulaire, les mécanismes de maladies, les réponses thérapeutiques et la biologie translationnelle.

Nous recherchons un Scientifique / Associate Scientist hautement motivé pour rejoindre une équipe de plateforme de génomique de pointe axée sur le séquençage single-cell, la transcriptomique spatiale et les applications de séquençage de nouvelle génération (NGS). Le candidat retenu travaillera à l'interface de la biologie moléculaire, de la génomique et de la recherche translationnelle, soutenant le développement et la mise en œuvre de technologies omics innovantes qui accélèrent la découverte scientifique et l'innovation thérapeutique.

Responsabilités clés

• Développer, optimiser et mettre en œuvre des flux de travail avancés basés sur le NGS avec un accent sur :
• Le séquençage de l'ARN single-cell (scRNA-seq)
• La transcriptomique spatiale
• Les approches de profilage multi-omics et multimodales
• Effectuer de manière indépendante des expériences de biologie moléculaire et dépanner des flux de travail complexes.
• Exécuter le traitement des échantillons, l'extraction d'acides nucléiques, la PCR/qPCR, la préparation de bibliothèques, le séquençage et les activités de contrôle de qualité.
• Générer, analyser et documenter les résultats expérimentaux avec un haut niveau de rigueur scientifique.
• Travailler avec des types d'échantillons difficiles, notamment des tissus FFPE, des échantillons primaires et des matériaux à faible apport.
• Collaborer étroitement avec les équipes de bioinformatique et de recherche interfonctionnelles pour interpréter les ensembles de données de séquençage et en dériver des informations biologiques.
• Assurer la génération de données de haute qualité, conformes aux principes FAIR.
• Présenter les découvertes scientifiques, les protocoles et les recommandations aux parties prenantes internes.
• Contribuer à l'innovation continue et à l'amélioration des capacités de la plateforme.

Qualifications requises

• Master en biologie moléculaire, biotechnologie, biochimie, sciences de la vie, génomique ou une discipline connexe.
• 1-3 ans d'expérience dans l'industrie ou en recherche pertinente en génomique ou biologie moléculaire.
• Expérience pratique des flux de travail de séquençage de nouvelle génération (NGS).
• Expertise solide en :
• Extraction d'ADN/ARN
• PCR et qPCR
• Préparation de bibliothèques NGS
• Techniques de laboratoire de biologie moléculaire
• Expérience dans la manipulation d'échantillons cliniques ou biologiques difficiles tels que le tissu FFPE, des spécimens de tumeurs ou des échantillons à faible apport.
• Capacité avérée à concevoir, exécuter, analyser et dépanner des expériences de manière indépendante.
• Solides compétences en communication et capacité à collaborer efficacement au sein d'équipes multidisciplinaires.
• Anglais courant.

Qualifications preferred

• Expérience pratique des plateformes de séquençage single-cell (10x Genomics Chromium).
• Expérience avec la transcriptomique spatiale et les technologies de biologie spatiale (Visium, Xenium, CosMx, RNAscope).
• Connaissance des approches de transcriptomique, de génomique et de multi-omics.
• Expérience dans le développement d'essais, l'optimisation de méthodes et la mise en œuvre de technologies.
• Familiarité avec les analyses bioinformatiques de base et l'interprétation des ensembles de données de séquençage.
• Expérience dans un environnement pharmaceutique, biotechnologique ou de recherche translationnelle.

Ce que nous recherchons

Nous sommes particulièrement intéressés par les candidats qui combinent une solide expertise en génomique de laboratoire (wet-lab) avec une passion pour les technologies émergentes telles que le séquençage single-cell et la biologie spatiale. Les candidats retenus sont curieux, innovants, collaboratifs et enthousiastes à l'idée d'appliquer des technologies omics de pointe pour faire progresser la recherche translationnelle et la découverte thérapeutique.

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