NGS Scientist (single-cell and spatial Omics)

Für unseren Kunden, ein führendes Pharmaunternehmen mit Sitz in Basel, suchen wir einen motivierten NGS Scientist-

Single-cell und Spatial-Omics-Technologien transformieren die biomedizinische Forschung, indem sie eine tiefe Charakterisierung komplexer biologischer Systeme bei beispielloser Auflösung ermöglichen. Diese Technologien liefern entscheidende Einblicke in zelluläre Heterogenität, Krankheitsmechanismen, therapeutische Reaktionen und translationale Biologie.

Wir suchen einen hochmotivierten Scientist / Associate Scientist, der ein hochmodernes Genomics-Plattformteam verstärkt, das sich auf Single-cell Sequencing, Spatial Transcriptomics und Next-Generation Sequencing (NGS) Anwendungen konzentriert. Der ideale Kandidat wird an der Schnittstelle von Molekularbiologie, Genomik und translationaler Forschung arbeiten und die Entwicklung sowie Implementierung innovativer Omics-Technologien unterstützen, welche die wissenschaftliche Entdeckung und therapeutische Innovation beschleunigen.

Hauptverantwortlichkeiten

• Entwicklung, Optimierung und Implementierung fortschrittlicher NGS-basierter Workflows mit Schwerpunkt auf:
• Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)
• Spatial transcriptomics
• Multi-omics und multimodale Profiling-Ansätze
• Selbstständige Durchführung molekularbiologischer Experimente und Fehlerbehebung bei komplexen Workflows.
• Durchführung von Probenverarbeitung, Nukleinsäureextraktion, PCR/qPCR, Library Preparation, Sequencing und Qualitätskontrollaktivitäten.
• Generierung, Analyse und Dokumentation experimenteller Ergebnisse mit einem hohen Maß an wissenschaftlicher Genauigkeit.
• Arbeit mit anspruchsvollen Probentypen, einschließlich FFPE-Gewebe, Primärproben und Low-input-Materialien.
• Enge Zusammenarbeit mit Bioinformatik- und funktionsübergreifenden Forschungsteams, um Sequencing-Datensätze zu interpretieren und biologische Erkenntnisse zu gewinnen.
• Sicherstellung der Generierung hochwertiger, FAIR-konformer Daten.
• Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse, Protokolle und Empfehlungen gegenüber internen Stakeholdern.
• Beitrag zu kontinuierlicher Innovation und Verbesserung der Plattformkapazitäten.

Erforderliche Qualifikationen

• Master-Abschluss in Molekularbiologie, Biotechnologie, Biochemie, Life Sciences, Genomik oder einer verwandten Disziplin.
• 1-3 Jahre Industrie- oder relevante Forschungserfahrung in Genomik oder Molekularbiologie.
• Hands-on-Erfahrung mit Next-Generation Sequencing (NGS) Workflows.
• Fundierte Expertise in:
• DNA/RNA-Extraktion
• PCR und qPCR
• NGS Library Preparation
• Molekularbiologischen Labortechniken
• Erfahrung im Umgang mit klinischen oder anspruchsvollen biologischen Proben wie FFPE-Gewebe, Tumorpräparaten oder Low-input-Proben.
• Nachgewiesene Fähigkeit, Experimente selbstständig zu konzipieren, durchzuführen, zu analysieren und Fehler zu beheben.
• Starke Kommunikationsfähigkeiten und die Fähigkeit, effektiv in multidisziplinären Teams zusammenzuarbeiten.
• Fließendes Englisch.

Bevorzugte Qualifikationen

• Hands-on-Erfahrung mit Single-cell Sequencing Plattformen (10x Genomics Chromium).
• Erfahrung mit Spatial Transcriptomics und Spatial-Biology-Technologien (Visium, Xenium, CosMx, RNAscope).
• Kenntnisse in Transcriptomics, Genomics und Multi-omics-Ansätzen.
• Erfahrung in der Assay-Entwicklung, Methodenoptimierung und Technologieimplementierung.
• Vertrautheit mit grundlegenden bioinformatischen Analysen und der Interpretation von Sequencing-Datensätzen.
• Erfahrung in einem pharmazeutischen, biotechnologischen oder translationalen Forschungsumfeld.

Was wir suchen

Wir sind besonders an Kandidaten interessiert, die fundierte Wet-Lab-Genomik-Expertise mit einer Leidenschaft für aufkommende Technologien wie Single-cell Sequencing und Spatial Biology kombinieren. Erfolgreiche Kandidaten sind neugierig, innovativ, kollaborativ und begeistert davon, modernste Omics-Technologien einzusetzen, um die translationale Forschung und die therapeutische Entdeckung voranzutreiben.

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